Во время проведения почерковедческой экспертизы относительно подписей производится их сравнительное исследование. Проходит оно путем сопоставления с образцами подписей лиц, которыми они выполнены, и только потом уже с почерком или подписью лица, которое могло бы их подделать. Если эти лица являются вымышленными (о чем должно быть указано в постановлении), сравнение сразу производится с почерком и подписью подозреваемого исполнителя.Сравнительное исследование подписей как часть почерковедческой экспертизы, позволяет эксперту решить вопрос о наличии изменений в почерке или подделывания подписей, или подражании чужому почерку.Во время проведения почерковедческой экспертизы на стадии сравнительного анализа почерка или подписи, используются различные технические приспособления (микроскоп, дисплей персонального компьютера и прочие оптические приборы).Также в процессе почерковедческой экспертизы могут быть применены различные математические методы. Например, с помощью измерительно-статистических методов, можно уточнить, являются ли обнаруженные различия в написании одних и тех же букв вариантами одного и того же или нескольких почерков.В некоторых случаях, которые считаются сложными из-за малого объема содержащегося материала, могут в процессе проведения почерковедческой экспертизы применяться компьютерные технологии.

К таким примерам можно отнести краткие цифровые записи, тексты, копирующие печатный шрифт, сложные подписи и т.д. Применение новейших компьютерных технологий расширяет возможности получения информации о человеке по почерку. Потому что компьютер может отметить такие детали, которые незаметны человеческому глазу.Одной из самых сложных стадий в почерковедческой экспертизе является оценка результатов, потому что на этом этапе очень важно принять правильное решение, ссылаясь на все полученные в ходе расследования данные. Среди всех обнаруженных признаков выделяются самые заметные и полезные.

Итоговая идентификация зависит от часто встречающихся признаков.Оценка совокупности выявленных признаков производится специалистом по почерковедческой экспертизе на основе только лишь профессиональных знаний и опыта. Поэтому здесь очень важна квалификация эксперта и его стаж работы в области почерковедения.